- 第1条第1項 （不開港への出入についての許可手数料）
- 第2条第1項 （保税蔵置場又は保税展示場の許可手数料）
- 第3条第1項 （保税工場の許可手数料）
- 第4条第1項 （総合保税地域の許可手数料）
- 第5条第1項 （指定地外検査の許可手数料）
- 第6条第1項
- 第7条第1項 （証明書類又は磁気テープ等の交付手数料）
- 第8条第1項 （製造工場の承認手数料）
- 第9条第1項 （手数料の納付の時期及び方法等）
- 第10条第1項
- 第11条第1項 （不開港への出入についての許可手数料の免除）
- 第12条第1項 （業務の休止による許可手数料の免除）
- 第13条第1項 （保税展示場の許可手数料の免除）
- 第13条の2第1項 （災害等による許可に係る手数料等の還付又は免除）
- 第13条の3第1項 （災害等による証明書類の交付に係る手数料の還付又は免除）
- 第13条の4第1項 （災害等による保税蔵置場に係る許可に係る手数料等の還付、軽減又は免除等）
- 第13条の5第1項 （国際物流拠点産業集積地域に係る手数料の軽減等）
- 第14条第1項 （手数料の前納等）
- 附則第1条第1項
- 附則昭和31年11月6日政令第328号第1条第1項
- 附則昭和32年3月31日政令第50号第1条第1項
- 附則昭和32年5月17日政令第105号第1条第1項
- 附則昭和35年3月31日政令第69号第1条第1項
- 附則昭和36年5月31日政令第151号第1条第1項
- 附則昭和36年10月27日政令第330号第1条第1項
- 附則昭和38年6月28日政令第225号第1条第1項
- 附則昭和39年3月31日政令第74号第1条第1項
- 附則昭和40年3月31日政令第92号第1条第1項
- 附則昭和40年5月31日政令第180号第1条第1項
- 附則昭和40年11月15日政令第356号第1条第1項
- 附則昭和41年3月31日政令第81号第1条第1項
- 附則昭和42年5月31日政令第113号第1条第1項
- 附則昭和45年4月27日政令第95号第1条第1項
- 附則昭和46年3月31日政令第86号第1条第1項
- 附則昭和49年3月30日政令第83号第1条第1項
- 附則昭和50年3月31日政令第67号第1条第1項
- 附則昭和50年10月1日政令第294号第1条第1項
- 附則昭和53年3月4日政令第29号第1条第1項
- 附則昭和53年3月22日政令第42号第1条第1項
- 附則昭和54年3月31日政令第60号第1条第1項
- 附則昭和55年3月31日政令第36号第1条第1項
- 附則昭和56年3月31日政令第69号第1条第1項 （施行期日）
- 附則昭和58年3月31日政令第48号第1条第1項 （施行期日）
- 附則昭和59年4月13日政令第96号第1条第1項 （施行期日）
- 附則昭和59年4月13日政令第96号第4条第1項 （税関関係手数料令の一部改正に伴う経過措置）
- 附則昭和60年12月20日政令第316号第1条第1項 （施行期日）
- 附則昭和60年12月21日政令第317号第1条第1項 （施行期日等）
- 附則昭和61年3月31日政令第87号第1条第1項 （施行期日）
- 附則昭和62年3月20日政令第47号第1条第1項 （施行期日）
- 附則昭和62年3月20日政令第47号第4条第1項 （税関関係手数料令の一部改正に伴う経過措置）
- 附則昭和62年8月13日政令第282号第1条第1項 （施行期日）
- 附則昭和63年3月31日政令第74号第1条第1項 （施行期日）
- 附則平成元年3月15日政令第43号第1条第1項 （施行期日）
- 附則平成元年3月15日政令第43号第2条第1項 （税関関係手数料令の一部改正に伴う経過措置）
- 附則平成3年3月19日政令第41号第1条第1項 （施行期日）
- 附則平成3年3月19日政令第41号第3条第1項 （税関関係手数料令の一部改正に伴う経過措置）
- 附則平成3年3月30日政令第90号第1条第1項 （施行期日）
- 附則平成4年3月31日政令第92号第1条第1項 （施行期日）
- 附則平成5年3月31日政令第88号第1条第1項 （施行期日）
- 附則平成6年3月24日政令第70号第1条第1項 （施行期日）
- 附則平成6年3月31日政令第113号第1条第1項 （施行期日）
- 附則平成6年7月27日政令第251号第1条第1項
- 附則平成6年12月28日政令第414号第1条第1項 （施行期日）
- 附則平成8年3月31日政令第92号第1条第1項 （施行期日）
- 附則平成9年3月28日政令第93号第1条第1項 （施行期日）
- 附則平成9年3月31日政令第110号第1条第1項 （施行期日）
- 附則平成9年3月31日政令第112号第1条第1項 （施行期日）
- 附則平成10年3月31日政令第123号第1条第1項 （施行期日）
- 附則平成11年6月11日政令第179号第1条第1項
- 附則平成12年3月23日政令第82号第1条第1項 （施行期日）
- 附則平成12年3月31日政令第187号第1条第1項
- 附則平成12年6月7日政令第307号第1条第1項 （施行期日）
- 附則平成13年3月31日政令第153号第1条第1項 （施行期日）
- 附則平成14年3月31日政令第111号第1条第1項 （施行期日）
- 附則平成15年3月31日政令第143号第1条第1項 （施行期日）
- 附則平成16年3月31日政令第107号第1条第1項 （施行期日）
- 附則平成16年3月31日政令第107号第4条第1項 （税関関係手数料令の一部改正に伴う経過措置）
- 附則平成17年3月31日政令第105号第1条第1項 （施行期日）
- 附則平成17年7月21日政令第249号第1条第1項
- 附則平成18年2月1日政令第14号第1条第1項 （施行期日）
- 附則平成19年6月29日政令第196号第1条第1項
- 附則平成19年9月20日政令第291号第1条第1項
- 附則平成20年3月31日政令第123号第1条第1項 （施行期日）
- 附則平成20年6月18日政令第197号第1条第1項 （施行期日）
- 附則平成20年6月27日政令第210号第1条第1項 （施行期日）
- 附則平成21年11月26日政令第267号第1条第1項 （施行期日）
- 附則平成23年3月31日政令第88号第1条第1項 （施行期日）
- 附則平成23年3月31日政令第88号第2条第1項 （税関関係手数料令の一部改正に伴う経過措置）
- 附則平成24年3月31日政令第111号第1条第1項
- 附則平成26年12月12日政令第393号第1条第1項
- 附則平成29年1月25日政令第6号第1条第1項 （施行期日）
- 附則平成30年7月11日政令第204号第1条第1項 （施行期日）
- 附則令和3年3月31日政令第131号第1条第1項
- 附則令和4年3月31日政令第135号第1条第1項
- 附則令和5年3月31日政令第158号第1条第1項 （施行期日）
- 附則令和5年3月31日政令第158号第4条第1項 （税関関係手数料令の一部改正に伴う経過措置）